MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella bongori NCTC 12419

Total Repeats: 78358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015761	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339998037
2	NC_015761	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339998037
3	NC_015761	ATCACC	3	18	223	240	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	339998037
4	NC_015761	CGG	2	6	367	372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998038
5	NC_015761	ACCA	2	8	479	486	50 %	0 %	0 %	50 %	339998038
6	NC_015761	TGG	2	6	489	494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339998038
7	NC_015761	GAT	2	6	496	501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998038
8	NC_015761	A	6	6	504	509	100 %	0 %	0 %	0 %	339998038
9	NC_015761	CGG	2	6	514	519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998038
10	NC_015761	CGT	2	6	625	630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998038
11	NC_015761	CTG	2	6	677	682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998038
12	NC_015761	CGC	2	6	706	711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998038
13	NC_015761	GTG	2	6	723	728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339998038
14	NC_015761	A	6	6	729	734	100 %	0 %	0 %	0 %	339998038
15	NC_015761	CAT	2	6	745	750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339998038
16	NC_015761	GATC	2	8	790	797	25 %	25 %	25 %	25 %	339998038
17	NC_015761	CCG	2	6	862	867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998038
18	NC_015761	CGC	2	6	871	876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998038
19	NC_015761	CGA	2	6	889	894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998038
20	NC_015761	CCTGAT	2	12	898	909	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339998038
21	NC_015761	CTG	2	6	921	926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998038
22	NC_015761	TGG	2	6	945	950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339998038
23	NC_015761	GCC	2	6	992	997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998038
24	NC_015761	GGAC	2	8	1026	1033	25 %	0 %	50 %	25 %	339998038
25	NC_015761	GT	3	6	1041	1046	0 %	50 %	50 %	0 %	339998038
26	NC_015761	CTG	2	6	1082	1087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998038
27	NC_015761	A	6	6	1195	1200	100 %	0 %	0 %	0 %	339998038
28	NC_015761	AAT	2	6	1286	1291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339998038
29	NC_015761	TCCGG	2	10	1310	1319	0 %	20 %	40 %	40 %	339998038
30	NC_015761	GGC	2	6	1342	1347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998038
31	NC_015761	GC	3	6	1346	1351	0 %	0 %	50 %	50 %	339998038
32	NC_015761	CCA	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339998038
33	NC_015761	CG	3	6	1454	1459	0 %	0 %	50 %	50 %	339998038
34	NC_015761	AAG	2	6	1497	1502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339998038
35	NC_015761	GGT	2	6	1549	1554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339998038
36	NC_015761	TTC	2	6	1595	1600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339998038
37	NC_015761	ACG	2	6	1694	1699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998038
38	NC_015761	CGG	2	6	1768	1773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998038
39	NC_015761	CGG	2	6	1777	1782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998038
40	NC_015761	AGC	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998038
41	NC_015761	CAA	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339998038
42	NC_015761	GAA	2	6	1822	1827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339998038
43	NC_015761	GT	3	6	1845	1850	0 %	50 %	50 %	0 %	339998038
44	NC_015761	GCG	2	6	1851	1856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998038
45	NC_015761	GTT	2	6	1873	1878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339998038
46	NC_015761	GCAA	2	8	1927	1934	50 %	0 %	25 %	25 %	339998038
47	NC_015761	ATC	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339998038
48	NC_015761	TCG	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998038
49	NC_015761	CCAG	2	8	2016	2023	25 %	0 %	25 %	50 %	339998038
50	NC_015761	TGT	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339998038
51	NC_015761	TCG	2	6	2099	2104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998038
52	NC_015761	ATT	2	6	2109	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339998038
53	NC_015761	CGC	2	6	2131	2136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998038
54	NC_015761	ACG	2	6	2146	2151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998038
55	NC_015761	CTG	2	6	2213	2218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998038
56	NC_015761	TC	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	339998038
57	NC_015761	CT	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	339998038
58	NC_015761	GC	3	6	2327	2332	0 %	0 %	50 %	50 %	339998038
59	NC_015761	CG	3	6	2358	2363	0 %	0 %	50 %	50 %	339998038
60	NC_015761	GAC	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998038
61	NC_015761	GCC	2	6	2537	2542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998038
62	NC_015761	TGA	2	6	2560	2565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998038
63	NC_015761	AGGTA	2	10	2566	2575	40 %	20 %	40 %	0 %	339998038
64	NC_015761	GT	3	6	2609	2614	0 %	50 %	50 %	0 %	339998038
65	NC_015761	TAT	2	6	2699	2704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339998038
66	NC_015761	CGG	2	6	2754	2759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998038
67	NC_015761	GT	3	6	2763	2768	0 %	50 %	50 %	0 %	339998038
68	NC_015761	CTG	2	6	2777	2782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998038
69	NC_015761	CGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998039
70	NC_015761	ATGA	2	8	3141	3148	50 %	25 %	25 %	0 %	339998039
71	NC_015761	GAT	2	6	3188	3193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998039
72	NC_015761	GCA	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998039
73	NC_015761	TGA	2	6	3271	3276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998039
74	NC_015761	GAA	2	6	3279	3284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339998039
75	NC_015761	CAGC	2	8	3296	3303	25 %	0 %	25 %	50 %	339998039
76	NC_015761	GC	4	8	3372	3379	0 %	0 %	50 %	50 %	339998039
77	NC_015761	CCG	2	6	3398	3403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998039
78	NC_015761	ATTGC	2	10	3409	3418	20 %	40 %	20 %	20 %	339998039
79	NC_015761	GCC	2	6	3477	3482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998039
80	NC_015761	TGA	2	6	3487	3492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998039
81	NC_015761	CG	4	8	3516	3523	0 %	0 %	50 %	50 %	339998039
82	NC_015761	CTGG	2	8	3656	3663	0 %	25 %	50 %	25 %	339998039
83	NC_015761	CGG	2	6	3718	3723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998039
84	NC_015761	T	8	8	3832	3839	0 %	100 %	0 %	0 %	339998040
85	NC_015761	GGA	2	6	3962	3967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339998040
86	NC_015761	CG	3	6	3975	3980	0 %	0 %	50 %	50 %	339998040
87	NC_015761	GTT	2	6	4037	4042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339998040
88	NC_015761	CGG	2	6	4073	4078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998040
89	NC_015761	GCG	2	6	4111	4116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998040
90	NC_015761	CGGCG	2	10	4157	4166	0 %	0 %	60 %	40 %	339998040
91	NC_015761	GTC	2	6	4203	4208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998040
92	NC_015761	GGC	2	6	4266	4271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998040
93	NC_015761	GAC	3	9	4338	4346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998040
94	NC_015761	CTG	2	6	4401	4406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998040
95	NC_015761	CTA	2	6	4418	4423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339998040
96	NC_015761	CG	3	6	4454	4459	0 %	0 %	50 %	50 %	339998040
97	NC_015761	TGG	2	6	4468	4473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339998040
98	NC_015761	CGC	2	6	4556	4561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998040
99	NC_015761	GATG	2	8	4646	4653	25 %	25 %	50 %	0 %	339998040
100	NC_015761	TCAG	2	8	4654	4661	25 %	25 %	25 %	25 %	339998040
101	NC_015761	CG	3	6	4675	4680	0 %	0 %	50 %	50 %	339998040
102	NC_015761	CCG	2	6	4694	4699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998040
103	NC_015761	GAT	2	6	4740	4745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998040
104	NC_015761	CCA	2	6	4747	4752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339998040
105	NC_015761	AG	3	6	4895	4900	50 %	0 %	50 %	0 %	339998040
106	NC_015761	CAT	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339998040
107	NC_015761	CTGC	2	8	4983	4990	0 %	25 %	25 %	50 %	339998040
108	NC_015761	TGA	3	9	5014	5022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998040
109	NC_015761	CTT	2	6	5168	5173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339998041
110	NC_015761	GTT	2	6	5210	5215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339998041
111	NC_015761	ATG	2	6	5239	5244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998041
112	NC_015761	TCA	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339998041
113	NC_015761	CG	3	6	5261	5266	0 %	0 %	50 %	50 %	339998041
114	NC_015761	ACC	2	6	5287	5292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339998041
115	NC_015761	T	7	7	5305	5311	0 %	100 %	0 %	0 %	339998041
116	NC_015761	TTC	2	6	5350	5355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339998041
117	NC_015761	ACC	2	6	5398	5403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339998041
118	NC_015761	AG	3	6	5562	5567	50 %	0 %	50 %	0 %	339998041
119	NC_015761	GCG	2	6	5765	5770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998041
120	NC_015761	TGAGA	2	10	5880	5889	40 %	20 %	40 %	0 %	339998041
121	NC_015761	ACC	2	6	6106	6111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339998042
122	NC_015761	CGA	2	6	6212	6217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998042
123	NC_015761	TAA	2	6	6240	6245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339998042
124	NC_015761	A	6	6	6276	6281	100 %	0 %	0 %	0 %	339998042
125	NC_015761	CAG	2	6	6447	6452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998042
126	NC_015761	ATC	2	6	6457	6462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339998042
127	NC_015761	TGA	2	6	6476	6481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998042
128	NC_015761	GCC	2	6	6550	6555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998042
129	NC_015761	CCAA	2	8	6675	6682	50 %	0 %	0 %	50 %	339998042
130	NC_015761	TGC	2	6	6749	6754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998042
131	NC_015761	AGC	2	6	6766	6771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998042
132	NC_015761	CAA	2	6	6950	6955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339998042
133	NC_015761	CG	3	6	7001	7006	0 %	0 %	50 %	50 %	339998042
134	NC_015761	GGCCG	2	10	7017	7026	0 %	0 %	60 %	40 %	339998042
135	NC_015761	AGG	2	6	7088	7093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339998042
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137	NC_015761	GCC	2	6	7143	7148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998042
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139	NC_015761	CCGCG	2	10	7194	7203	0 %	0 %	40 %	60 %	339998042
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264	NC_015761	GGC	2	6	14280	14285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998050
265	NC_015761	CGG	3	9	14300	14308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998050
266	NC_015761	GGC	2	6	14367	14372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998050
267	NC_015761	GTC	2	6	14380	14385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998050
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273	NC_015761	ACA	2	6	14597	14602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339998050
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382	NC_015761	A	6	6	20084	20089	100 %	0 %	0 %	0 %	339998055
383	NC_015761	TCT	2	6	20137	20142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339998055
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385	NC_015761	GTT	2	6	20215	20220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339998055
386	NC_015761	AGA	2	6	20253	20258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339998055
387	NC_015761	TGG	2	6	20380	20385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339998055
388	NC_015761	CGG	2	6	20421	20426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998055
389	NC_015761	CTA	2	6	20448	20453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339998055
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